Исполнительным органом является элемент управляемого объекта, осуществляющий непосредственное воздействие на объект по командным сигналам управления. К исполнительным органам относятся пускатели, двух и трехпозиционная арматура, регулирующие клапаны, устройства для изменения производительности компрессоров и т. д. В системах регулирования исполнительными органами управляют регуляторы. Это не исключает, однако, воздействия системы управления или оператора на те же исполнительные органы. Примером такого воздействия является принудительное уменьшение производительности винтового компрессора при чрезмерном, увеличении потребляемой мощности.
Основные операции управления исполнительными органами выполняются при вводе и выводе из действия установки в целом или отдельных машин, включении резервного оборудования, проведении оттайки воздухоохладителей, выпуске воздуха из системы хладагента, дозарядке масла в компрессорные агрегаты. В той или иной мере автоматизация управления исполнительными органами предусмотрена для всех судовых холодильных установок. Ввод в действие холодильных установок после длительной остановки всегда осуществляется при участии оператора. Включение и выключение отдельных компрессоров, насосов и теплообменных аппаратов в режимах нормальной эксплуатации может осуществляться автоматически. Включение резервного оборудования при выходе из строя основного обязательно должно быть автоматизировано. Уровень автоматизации управления исполнительными органами при выполнении операций, относящихся к техническому обслуживанию холодильных установок, весьма различен на различных судах. Целесообразно рассматривать управление функционально связанными группами исполнительных органов. Потому ниже по отдельности описана структура подсистем управления компрессорами, насосами, воздухоохладителями.